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Technical articles通用基因組 DNA 提取試劑盒使用說明書
規(guī)格:50T/ 100T
保存:室溫(15℃-25℃) 干燥保存,復檢期 12 個月,2℃-8℃保存時間更長。開封后請將 RNase A,蛋白酶 K于-20℃保存。
試劑盒內(nèi)容: 50T 100T
RNase A 1ml 1ml×2
蛋白酶 K 1ml 1ml×2
溶液 A 25ml 50ml
溶液 B 25ml 50ml
漂洗液 15ml 15ml×2
洗脫液 15ml 30ml
吸附柱 50個 100個
收集管 50個 100個
說明書 1份 1份
產(chǎn)品簡介:
本試劑盒為通用型,適合于從土壤,糞便,昆蟲,以及其他樣本中提取基因組 DNA。對細菌,真菌,昆蟲等樣本都具有很好的裂解效果,大限度的保留了生物 DNA 的多態(tài)性。
使用本試劑盒提取的 DNA 產(chǎn)量大、完整性好,可直接用于各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR 、文庫構(gòu)建、Southern 雜交等實驗。
操作步驟:
使用前請先在漂洗液中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶上的標簽。所有離心步驟均為使用臺式離心機
在室溫下離心。
1、樣品的處理:
1)土壤:稱取 0.1-0.3g (根據(jù)干濕)土壤,放入研缽中,倒入適量的液氮,立即研磨,重復 3 次,使土壤顆粒研成粉末,加 500ul 溶液 A,振蕩至*懸浮。
2)糞便:稱取 0.1-0.3g (根據(jù)干濕) 糞便,加 500ul 溶液 A,振蕩至*懸浮。
3)昆蟲:稱取 0.1-0.3g 昆蟲,倒入適量的液氮,立即研磨,重復 3 次,使昆蟲研成粉末,加 500ul 溶液A,振蕩至*懸浮。
4)未知樣品,如為細未狀,可直接稱取 0.1-0.3g(根據(jù)干濕)加 500ul 溶液 A,如為塊狀,可 0.1-0.3g 用液氮研磨成粉未,再加 500ul 溶液 A,振蕩至*懸浮。
2、向懸浮液中加入 20ul 的 RNase A(10mg/ml),55℃放置 10min。
3、加入 20ul 的蛋白酶 K(10mg/ml),充分混勻,55℃水浴消化,30min。消化期間可顛倒離心管混勻數(shù)次,12000 轉(zhuǎn)離心 10min。將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中。如有沉淀,可再次離心。
4、加入 500ul 溶液 B,充分混勻。如出現(xiàn)白色沉淀,于 55℃放置 5min,沉淀即會消失,不影響后續(xù)實驗。如溶液未變清亮,說明樣品消化不*,可能導致提取的 DNA 量少及不純,還有可能導致上柱后堵柱子,請增加消化時間。
5、加入 500ul 無水乙醇,充分混勻,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀,不影響 DNA 的提取,可將溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中,放置 2min (分兩次加入,每次 700ul)。
6、12000rpm 離心 2min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入 600ul 漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm 離心 1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
8、向吸附柱中加入 600ul 漂洗液,12000rpm 離心 1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中
9、12000rpm 離心 2min,將吸附柱置于室溫或 50℃溫箱放置數(shù)分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會影響后續(xù)的實驗如酶切、PCR 等。
10、將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜中央懸空滴加 50-200ul 經(jīng) 65℃水浴預熱的洗脫液,室溫放置 5min,12000rpm 離心 2min。
11、離心所得洗脫液再加入吸附柱中,室溫放置 2min,12000rpm 離心 2min,即可得到高質(zhì)量的基因組 DNA。
注意事項:
1、由于樣品不同,終提取的 DNA 含量和純度也有所不同,一般來說,如果所提取 DNA 用電泳的方法檢測不到,PCR 會有結(jié)果,樣品盡可能的新鮮。否則會導致提取的 DNA 片段較小且提取量也下降。
2、若試劑盒中的溶液出現(xiàn)沉淀,可在 65℃水浴中重新溶解后再使用,不影響提取效果。
3、如果樣品消化不*,后面的離心步驟中可能會出現(xiàn)堵柱子的情況,可適當延長離心時間。
4、洗脫緩沖液的體積不少于 50ul,體積過小會影響回收效率;洗脫液的 pH 值對洗脫效率也有影響,若需要用水做洗脫液應保證其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 將水的 pH 值調(diào)至此范圍),pH 值低于 7.0 會降低洗脫效率;DNA 產(chǎn)物應保存在-20℃,以防 DNA 降解。
5、DNA 濃度及純度檢測(濃度較高時):得到的基因組 DNA 片段的大小與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關?;厥盏玫降?/span> DNA 片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。DNA 應在 OD260 處有顯著吸收峰, OD260 值為 1 相當于大約 50μg/ml 雙鏈 DNA、40μg/ml 單鏈 DNA。OD260/OD280 比值應為 1.7-1.9,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水,比值會偏低,因為 pH 值和離子存在會影響光吸收值,但并不表示純度低。